明治・大正期のキリスト教思想家・伝道者の内村鑑三(うちむら かんぞう、1861–1930)に関する和書1,099冊、洋書30冊、資料105点、雑誌150種が収蔵されている。内村鑑三の生誕100年を記念して内村鑑三先生記念文庫設置世話人会が関連資料を収集し、1964年に同会から国際基督教大学図書館に収集資料が寄託された。以後、図書館が継続して図書・資料を収集している。文庫には、内村鑑三の著書、編集発行雑誌、論文、全集、書簡、自筆原稿、写真等を中心に、内村鑑三についての研究書、伝記、評論等が収蔵されている。内村が青年時代に愛読した書き入れのある書物も含まれる。なお、内村の晩年の蔵書約1,000冊が北海道大学図書館に「内村鑑三文庫」として所蔵されている。内村鑑三の略歴については、北海道大学図書館の「内村鑑三文庫」の項を参照されたい。 本文庫の目録として『内村鑑三記念文庫目録』(第3版、1997)が刊行されている。また、図書館ホームページで目録が公開されている。
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